|
KEMENTERIAN PENDIDIKAN TINGGI, SAINS, DAN TEKNOLOGI
UNIVERSITAS NEGERI PADANG
– FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
– PROGRAM STUDI PENDIDIKAN KIMIA (S2)
|
||||||
| RENCANA PEMBELAJARAN SEMESTER | |||||||
| MATA KULIAH (MK) | KODE | Rumpun MK | BOBOT (sks) | SEMESTER | Tgl Penyusunan | ||
| Biokimia Lanjut | KIM.82.0005 | - | 0 | 2 | 1 | - | |
| OTORISASI / PENGESAHAN | Dosen Pengembang RPS | Koordinator RMK | Koordinator Prodi | ||||
| - | - | - | Alizar S.Pd., M.Sc., Ph.D. | ||||
| Capaian Pembelajaran |
CPL-PRODI yang dibebankan pada MK | |
| CPL-2 | Memiliki kemampuan komunikasi yang efektif dan kerjasama team dalam interaksi sosial dan pekerjaan (komunikasi dan Kerjasama team / transferable skill) | |
| CPL-3 | Mampu berfikir logis, kritis dan inovatif dalam menganalisis, dan mengembangkan serta memberikan solusi terhadap permasalahan yang sesuai dengan bidang keahlian | |
| CPL-4 | Menguasai materi kimia yang dapat diaplikasikan pada pembelajaran kimia | |
| CPL-5 | Menerapkan dan mengembangkan pengetahuan dan teknologi dalam bidang pendidikan kimia | |
| CPL-8 | Melakukan inovasi dalam bidang pendidikan kimia berbasis teknologi sebagai dasar dalam pengembangan diri berkelanjutan | |
| Capaian Pembelajaran Mata Kuliah (CPMK) | ||
| CPMK 1 | CPMK2. Mengomunikasikan informasi ilmiah di bidang biokimia secara lisan dan tulisan berdasarkan kaidah ilmiah. | |
| CPMK 2 | CPMK4. Menganalisis dan menginterpretasikan hasil teknik biologi molekuler untuk menyelesaikan permasalahan di bidang biokimia. | |
| CPMK 3 | CPMK1. Memahami konsep biologi molekuler yang meliputi materi genetik, aliran informasi genetik, teknologi DNA rekombinan, PCR, kloning, dan sekuensing DNA. | |
| CPMK 4 | CPMK3. Terampil memanfaatkan basis data biokimia dan bioinformatika untuk memperoleh informasi ilmiah terkini. | |
| CPMK 5 | Mengomunikasikan informasi ilmiah di bidang biokimia secara lisan dan tulisan berdasarkan kaidah ilmiah. | |
| CPMK 6 | Menganalisis dan menginterpretasikan hasil teknik biologi molekuler untuk menyelesaikan permasalahan di bidang biokimia. | |
| CPMK 7 | Memahami konsep biologi molekuler yang meliputi materi genetik, aliran informasi genetik, teknologi DNA rekombinan, PCR, kloning, dan sekuensing DNA. | |
| CPMK 8 | Terampil memanfaatkan basis data biokimia dan bioinformatika untuk memperoleh informasi ilmiah terkini. | |
| Kemampuan akhir tiap tahapan belajar (Sub-CPMK) | ||
| SUB CPMK 1 | menjelaskan kaitan pewarisan sifat sel dengan DNA, biologi molekuler dan bioteknologi (5%) | |
| SUB CPMK 2 | 2. Membedakan DNA kromosom eukariot, DNA kromosom prokariot dan DNA plasmid 3. Terampil menggunakan basis data biokimia tentang DNA, protein dan enzim (22%) | |
| SUB CPMK 3 | 4. Menganalisis kaitan struktur, sifat DNA dan prinsip elektroforesis DNA dan spektrofotometer 5. Menganalisis data elektroforesis DNA (kadar dan ukuran) (8%) | |
| SUB CPMK 4 | 6. Menganalisis kaitan replikasi, transkripsi dan translasi sebagai aliran genetik pada makhluk hidup 7. Menganalisis kaitan timbal balik antara sekuens suatu gen pada DNA, mRNA dengan sekuens protein (11%) | |
| SUB CPMK 5 | 8. Menjelaskan penemuan kode genetik dan sifat universalnya 9. Menganalisis keteraturan basa nitrogen pada kodon dan dampaknya pada mutasi DNA (5%) | |
| SUB CPMK 6 | CPMK2. Mengomunikasikan informasi ilmiah di bidang biokimia secara lisan dan tulisan berdasarkan kaidah ilmiah. (51%) | |
| SUB CPMK 7 | 10.Membedakan ujung produk DNA akibat aktivitas enzim restriksi tertentu 11.Menemukan posisi pemotongan enzim restriksi pada sekuens DNA (manual dan program) (11%) | |
| SUB CPMK 8 | 12.Mengidentifikasi vektor menggunakan elektroforesis DNA secara teoritis (5%) | |
| Matriks CPL ke CPMK |
|
| Deskripsi Singkat Mata Kuliah |
- |
| Pustaka | Utama: |
|
1. 1. Loenen et al., (2013) Highlights of the DNA cutters: a short history of the restriction enzymes
2. 2. Watson et al., (2004) Molecular biology of the Gene, 5 ed. The Benjamin/ Cummings Publishing Company, Inc
3. 3. Nelson DL, Cox MM. (2013). Lehninger Principles of Biochemistry. 6th ed, New York: WH Freeman and Company.
4. 4. Brown TA (1992). Genetics a molecular approach. Second edition
|
|
|
Pendukung: (Jika diperlukan)
1. 1. Ahadul Putra, Minda Azhar, Iryani, Yuni Ahda, Fernita Puspasari, Ihsanawati, and Dessy Natalia. Cloning, sequencing and analyzing of 16S rRNA Gene from Inulin HydrolyzingBacteria
2. 2. Primrose SB; Twyman RM, Old RW (2003). Principle of gene manipulation
3. 3. Minda Azhar (1999). Proses translasi pada ragi Saccharomyces cerevisiae (Reviews). Jurnal Kimia Andalas pada
http://repository.unand.ac.id/3205/
|
|
| Dosen Pengampu |
- |
| Mata kuliah syarat |
- |
| Minggu Ke- | SUB-CPMK (Kemampuan Akhir Yang Diharapkan) | Penilaian | Bentuk Pembelajaran, Metode Pembelajaran, Penugasan Mahasiswa [Estimasi Waktu] |
Materi Pembelajaran [Rujukan] |
Bobot Penilaian (%) |
||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Indikator | Teknik & Kriteria | Luring (Tatap Muka) | Daring (Online) | ||||
| 1 |
menjelaskan kaitan pewarisan sifat sel dengan DNA, biologi molekuler dan bioteknologi
|
1. Keaktifan dalam kegiatan diskusi dan tanya jawab 2. Kelengkapan dan keakuratan tugas 3. Kelengkapan dan kebenaran dalam jawaban tugas Ketajaman analisis. |
Tugas
|
- | Tugas individu download artikel |
Pendahuluan 1. Kaitan matakuliah ini dengan biokimia, bioinformatika, bioteknologi dan matakuliah lain 2. Kaitan pewarisan sifat sel dengan DNA, biologi molekuler dan bioteknologi [2. Watson et al., (2004) Molecular biology of the Gene, 5 ed. The Benjamin/ Cummings Publishing Company, Inc]
|
5 |
| 2 |
2. Membedakan DNA kromosom eukariot, DNA kromosom prokariot dan DNA plasmid
3. Terampil menggunakan basis data biokimia tentang DNA, protein dan enzim
|
Ketajaman analisis pada diskusi |
Tugas
|
- | Ketajaman analisis pada diskusi |
Material Genetik 1. Material genetik virus 2. DNA kromosom bakteri dan DNA kromosom eukariot 3. DNA plasmid 4. Gene 5. Hubungan timbal balik sekuens mRNA, protein dengan DNA 6. Basis Data Bio: GenBank, PDB, CaZy [2. Watson et al., (2004) Molecular biology of the Gene, 5 ed. The Benjamin/ Cummings Publishing Company, Inc]
[3. Nelson DL, Cox MM. (2013). Lehninger Principles of Biochemistry. 6th ed, New York: WH Freeman and Company.]
|
22 |
| 3 |
2. Membedakan DNA kromosom eukariot, DNA kromosom prokariot dan DNA plasmid
3. Terampil menggunakan basis data biokimia tentang DNA, protein dan enzim
|
Ketajaman analisis pada diskusi |
Tugas
|
- | Ketajaman analisis pada diskusi |
Material Genetik 1. Material genetik virus 2. DNA kromosom bakteri dan DNA kromosom eukariot 3. DNA plasmid 4. Gene 5. Hubungan timbal balik sekuens mRNA, protein dengan DNA 6. Basis Data Bio: GenBank, PDB, CaZy [2. Watson et al., (2004) Molecular biology of the Gene, 5 ed. The Benjamin/ Cummings Publishing Company, Inc]
[3. Nelson DL, Cox MM. (2013). Lehninger Principles of Biochemistry. 6th ed, New York: WH Freeman and Company.]
|
22 |
| 4 |
4. Menganalisis kaitan struktur, sifat DNA dan prinsip elektroforesis DNA dan spektrofotometer
5. Menganalisis data elektroforesis DNA (kadar dan ukuran)
|
Ketajaman analisis pada diskusi |
Tugas
|
- | Tugas individu langkah identifikasi ukuran DNA |
Identifikasi DNA 1. Elektroforesis DNA 2. Spektrofotometer [2. Watson et al., (2004) Molecular biology of the Gene, 5 ed. The Benjamin/ Cummings Publishing Company, Inc]
[4. Brown TA (1992). Genetics a molecular approach. Second edition]
[1. Ahadul Putra, Minda Azhar, Iryani, Yuni Ahda, Fernita Puspasari, Ihsanawati, and Dessy Natalia. Cloning, sequencing and analyzing of 16S rRNA Gene from Inulin HydrolyzingBacteria]
|
8 |
| 5 |
6. Menganalisis kaitan replikasi, transkripsi dan translasi sebagai aliran genetik pada makhluk hidup
7. Menganalisis kaitan timbal balik antara sekuens suatu gen pada DNA, mRNA dengan sekuens protein
|
Ketajaman analisis pada diskusi tugas |
Tugas
Case-Based
|
- | Tugas individu download vidio pembela aran replikasi, transkripsi dan translasi |
Aliran informasi genetika 1. Dogma sentral 2. Replikasi 3. Transkripsi 4. Translasi [3. Nelson DL, Cox MM. (2013). Lehninger Principles of Biochemistry. 6th ed, New York: WH Freeman and Company.]
[4. Brown TA (1992). Genetics a molecular approach. Second edition]
[2. Primrose SB; Twyman RM, Old RW (2003). Principle of gene manipulation]
[3. Minda Azhar (1999). Proses translasi pada ragi Saccharomyces cerevisiae (Reviews). Jurnal Kimia Andalas pada
http://repository.unand.ac.id/3205/]
|
11 |
| 6 |
6. Menganalisis kaitan replikasi, transkripsi dan translasi sebagai aliran genetik pada makhluk hidup
7. Menganalisis kaitan timbal balik antara sekuens suatu gen pada DNA, mRNA dengan sekuens protein
|
Ketajaman analisis pada diskusi tugas |
Tugas
Case-Based
|
- | Tugas individu download vidio pembela aran replikasi, transkripsi dan translasi |
Aliran informasi genetika 1. Dogma sentral 2. Replikasi 3. Transkripsi 4. Translasi [3. Nelson DL, Cox MM. (2013). Lehninger Principles of Biochemistry. 6th ed, New York: WH Freeman and Company.]
[4. Brown TA (1992). Genetics a molecular approach. Second edition]
[2. Primrose SB; Twyman RM, Old RW (2003). Principle of gene manipulation]
[3. Minda Azhar (1999). Proses translasi pada ragi Saccharomyces cerevisiae (Reviews). Jurnal Kimia Andalas pada
http://repository.unand.ac.id/3205/]
|
11 |
| 7 |
8. Menjelaskan penemuan kode genetik dan sifat universalnya
9. Menganalisis keteraturan basa nitrogen pada kodon dan dampaknya pada mutasi DNA
|
Kebenaran penulisan kode genetik dan download kode genetik pada sistem database |
Tugas
|
- | Tugas individu download kode genetik |
Kode genetik 1. Penemuan kode genetik 2. Arti kode genetik (Kodon dan Antikodon) 3. Sifat universal kode genetik 4. Program pada analysis tools [2. Watson et al., (2004) Molecular biology of the Gene, 5 ed. The Benjamin/ Cummings Publishing Company, Inc]
[3. Nelson DL, Cox MM. (2013). Lehninger Principles of Biochemistry. 6th ed, New York: WH Freeman and Company.]
[4. Brown TA (1992). Genetics a molecular approach. Second edition]
|
5 |
| 8 | UTS | ||||||
| 9 |
10.Membedakan ujung produk DNA akibat aktivitas enzim restriksi tertentu
11.Menemukan posisi pemotongan enzim restriksi pada sekuens DNA (manual dan program)
|
Ketepatan tugas individu Catat minimal 30 enzim rekstriksi |
Tugas
|
- | Tugas individu Catat minimal 30 enzim rekstriksi |
Enzim Restriksi 1. Penemuan enzim restriksi 2. Tipe enzim restriksi 3. Penggunaan enzim restriksi pada molecular cloning 4. Program untuk menemukan posisi pemotongan enzim restriksi pada plasmid [1. Loenen et al., (2013) Highlights of the DNA cutters: a short history of the restriction enzymes]
[2. Watson et al., (2004) Molecular biology of the Gene, 5 ed. The Benjamin/ Cummings Publishing Company, Inc]
[3. Nelson DL, Cox MM. (2013). Lehninger Principles of Biochemistry. 6th ed, New York: WH Freeman and Company.]
[4. Brown TA (1992). Genetics a molecular approach. Second edition]
|
11 |
| 10 |
12.Mengidentifikasi vektor menggunakan elektroforesis DNA secara teoritis
|
Ketajaman analisis dalam menggabungkan plasmid pPBR322 pGEM-T Easy dengan gen |
Tugas
|
- | Tugas individu download plasmid pPBR322 pGEM-T Easy |
Type of Vectors 1. Plasmid pBR322 2. Plasmid pGEM-T Easy 3. Plasmid Ti dan Agrobacterium tumefaciens 4. Peta restriksi plasmid dan sisi insersi 5. Identifikasi DNA plasmid dengan elektrolisis DNA [1. Loenen et al., (2013) Highlights of the DNA cutters: a short history of the restriction enzymes]
[2. Watson et al., (2004) Molecular biology of the Gene, 5 ed. The Benjamin/ Cummings Publishing Company, Inc]
[3. Nelson DL, Cox MM. (2013). Lehninger Principles of Biochemistry. 6th ed, New York: WH Freeman and Company.]
[4. Brown TA (1992). Genetics a molecular approach. Second edition]
|
5 |
| 11 |
12.Mengidentifikasi vektor menggunakan elektroforesis DNA secara teoritis
|
Ketajaman analisis dalam menggabungkan plasmid pPBR322 pGEM-T Easy dengan gen |
Tugas
|
- | Tugas individu download plasmid pPBR322 pGEM-T Easy |
Type of Vectors 1. Plasmid pBR322 2. Plasmid pGEM-T Easy 3. Plasmid Ti dan Agrobacterium tumefaciens 4. Peta restriksi plasmid dan sisi insersi 5. Identifikasi DNA plasmid dengan elektrolisis DNA [1. Loenen et al., (2013) Highlights of the DNA cutters: a short history of the restriction enzymes]
[2. Watson et al., (2004) Molecular biology of the Gene, 5 ed. The Benjamin/ Cummings Publishing Company, Inc]
[3. Nelson DL, Cox MM. (2013). Lehninger Principles of Biochemistry. 6th ed, New York: WH Freeman and Company.]
[4. Brown TA (1992). Genetics a molecular approach. Second edition]
|
5 |