Matakuliah

Biokimia Lanjut

- Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam

Deskripsi Mata Kuliah

CPL Program Studi pada MK

CPL-2 - Memiliki kemampuan komunikasi yang efektif dan kerjasama team dalam interaksi sosial dan pekerjaan (komunikasi dan Kerjasama team / transferable skill)

CPL-3 - Mampu berfikir logis, kritis dan inovatif dalam menganalisis, dan mengembangkan serta memberikan solusi terhadap permasalahan yang sesuai dengan bidang keahlian

CPL-4 - Menguasai materi kimia yang dapat diaplikasikan pada pembelajaran kimia

CPL-5 - Menerapkan dan mengembangkan pengetahuan dan teknologi dalam bidang pendidikan kimia

CPL-8 - Melakukan inovasi dalam bidang pendidikan kimia berbasis teknologi sebagai dasar dalam pengembangan diri berkelanjutan

CPMK

CPMK-1 - CPMK2. Mengomunikasikan informasi ilmiah di bidang biokimia secara lisan dan tulisan berdasarkan kaidah ilmiah.

CPMK-2 - CPMK4. Menganalisis dan menginterpretasikan hasil teknik biologi molekuler untuk menyelesaikan permasalahan di bidang biokimia.

CPMK-3 - CPMK1. Memahami konsep biologi molekuler yang meliputi materi genetik, aliran informasi genetik, teknologi DNA rekombinan, PCR, kloning, dan sekuensing DNA.

CPMK-4 - CPMK3. Terampil memanfaatkan basis data biokimia dan bioinformatika untuk memperoleh informasi ilmiah terkini.

CPMK-5 - Mengomunikasikan informasi ilmiah di bidang biokimia secara lisan dan tulisan berdasarkan kaidah ilmiah.

CPMK-6 - Menganalisis dan menginterpretasikan hasil teknik biologi molekuler untuk menyelesaikan permasalahan di bidang biokimia.

CPMK-7 - Memahami konsep biologi molekuler yang meliputi materi genetik, aliran informasi genetik, teknologi DNA rekombinan, PCR, kloning, dan sekuensing DNA.

CPMK-8 - Terampil memanfaatkan basis data biokimia dan bioinformatika untuk memperoleh informasi ilmiah terkini.

Aktivitas Pembelajaran

Pertemuan 1 - Pendahuluan 1. Kaitan matakuliah ini dengan biokimia, bioinformatika, bioteknologi dan matakuliah lain 2. Kaitan pewarisan sifat sel dengan DNA, biologi molekuler dan bioteknologi

Minggu 1

Sub-CPMK: menjelaskan kaitan pewarisan sifat sel dengan DNA, biologi molekuler dan bioteknologi
Materi: Pendahuluan

1. Kaitan matakuliah ini dengan biokimia, bioinformatika, bioteknologi dan matakuliah lain

2. Kaitan pewarisan sifat sel dengan DNA, biologi molekuler dan bioteknologi
Metode: Tugas individu download artikel
Indikator: 1. Keaktifan dalam kegiatan diskusi dan tanya jawab

2. Kelengkapan dan keakuratan tugas

3. Kelengkapan dan kebenaran dalam jawaban tugas Ketajaman analisis.
Penilaian: Tugas

Pertemuan 2 - Material Genetik 1. Material genetik virus 2. DNA kromosom bakteri dan DNA kromosom eukariot 3. DNA plasmid 4. Gene 5. Hubungan timbal balik sekuens mRNA, protein dengan DNA 6. Basis Data Bio: GenBank, PDB, CaZy

Minggu 2

Sub-CPMK: 2. Membedakan DNA kromosom eukariot, DNA kromosom prokariot dan DNA plasmid

3. Terampil menggunakan basis data biokimia tentang DNA, protein dan enzim
Materi: Material Genetik

1. Material genetik virus

2. DNA kromosom bakteri dan DNA kromosom eukariot

3. DNA plasmid

4. Gene

5. Hubungan timbal balik sekuens mRNA, protein dengan DNA

6. Basis Data Bio: GenBank, PDB, CaZy
Metode: Ketajaman analisis pada diskusi
Indikator: Ketajaman analisis pada diskusi
Penilaian: Tugas

Pertemuan 3 - Material Genetik 1. Material genetik virus 2. DNA kromosom bakteri dan DNA kromosom eukariot 3. DNA plasmid 4. Gene 5. Hubungan timbal balik sekuens mRNA, protein dengan DNA 6. Basis Data Bio: GenBank, PDB, CaZy

Minggu 3

Pertemuan 4 - Identifikasi DNA 1. Elektroforesis DNA 2. Spektrofotometer

Minggu 4

Sub-CPMK: 4. Menganalisis kaitan struktur, sifat DNA dan prinsip elektroforesis DNA dan spektrofotometer

5. Menganalisis data elektroforesis DNA (kadar dan ukuran)
Materi: Identifikasi DNA

1. Elektroforesis DNA

2. Spektrofotometer
Metode: Tugas individu langkah identifikasi ukuran DNA
Indikator: Ketajaman analisis pada diskusi
Penilaian: Tugas

Pertemuan 5 - Aliran informasi genetika 1. Dogma sentral 2. Replikasi 3. Transkripsi 4. Translasi

Minggu 5

Sub-CPMK: 6. Menganalisis kaitan replikasi, transkripsi dan translasi sebagai aliran genetik pada makhluk hidup

7. Menganalisis kaitan timbal balik antara sekuens suatu gen pada DNA, mRNA dengan sekuens protein
Materi: Aliran informasi genetika

1. Dogma sentral

2. Replikasi

3. Transkripsi

4. Translasi
Metode: Tugas individu download vidio pembela aran replikasi, transkripsi dan translasi
Indikator: Ketajaman analisis pada diskusi tugas
Penilaian: Tugas; Case-Based

Pertemuan 6 - Aliran informasi genetika 1. Dogma sentral 2. Replikasi 3. Transkripsi 4. Translasi

Minggu 6

Pertemuan 7 - Kode genetik 1. Penemuan kode genetik 2. Arti kode genetik (Kodon dan Antikodon) 3. Sifat universal kode genetik 4. Program pada analysis tools

Minggu 7

Sub-CPMK: 8. Menjelaskan penemuan kode genetik dan sifat universalnya

9. Menganalisis keteraturan basa nitrogen pada kodon dan dampaknya pada mutasi DNA
Materi: Kode genetik

1. Penemuan kode genetik

2. Arti kode genetik (Kodon dan Antikodon)

3. Sifat universal kode genetik

4. Program pada analysis tools
Metode: Tugas individu download kode genetik
Indikator: Kebenaran penulisan kode genetik dan download kode genetik pada sistem database
Penilaian: Tugas

Pertemuan 8 - CPMK2. Mengomunikasikan informasi ilmiah di bidang biokimia secara lisan dan tulisan berdasarkan kaidah ilmiah.

Minggu 8

Sub-CPMK: CPMK2. Mengomunikasikan informasi ilmiah di bidang biokimia secara lisan dan tulisan berdasarkan kaidah ilmiah.

Pertemuan 9 - Enzim Restriksi 1. Penemuan enzim restriksi 2. Tipe enzim restriksi 3. Penggunaan enzim restriksi pada molecular cloning 4. Program untuk menemukan posisi pemotongan enzim restriksi pada plasmid

Minggu 9

Sub-CPMK: 10.Membedakan ujung produk DNA akibat aktivitas enzim restriksi tertentu

11.Menemukan posisi pemotongan enzim restriksi pada sekuens DNA (manual dan program)
Materi: Enzim Restriksi

1. Penemuan enzim restriksi

2. Tipe enzim restriksi

3. Penggunaan enzim restriksi pada molecular cloning

4. Program untuk menemukan posisi pemotongan enzim restriksi pada plasmid
Metode: Tugas individu Catat minimal 30 enzim rekstriksi
Indikator: Ketepatan tugas individu Catat minimal 30 enzim rekstriksi
Penilaian: Tugas

Pertemuan 10 - Type of Vectors 1. Plasmid pBR322 2. Plasmid pGEM-T Easy 3. Plasmid Ti dan Agrobacterium tumefaciens 4. Peta restriksi plasmid dan sisi insersi 5. Identifikasi DNA plasmid dengan elektrolisis DNA

Minggu 10

Sub-CPMK: 12.Mengidentifikasi vektor menggunakan elektroforesis DNA secara teoritis
Materi: Type of Vectors

1. Plasmid pBR322

2. Plasmid pGEM-T Easy

3. Plasmid Ti dan Agrobacterium tumefaciens

4. Peta restriksi plasmid dan sisi insersi

5. Identifikasi DNA plasmid dengan elektrolisis DNA
Metode: Tugas individu download plasmid pPBR322 pGEM-T Easy
Indikator: Ketajaman analisis dalam menggabungkan plasmid pPBR322 pGEM-T Easy dengan gen
Penilaian: Tugas

Pertemuan 11 - Type of Vectors 1. Plasmid pBR322 2. Plasmid pGEM-T Easy 3. Plasmid Ti dan Agrobacterium tumefaciens 4. Peta restriksi plasmid dan sisi insersi 5. Identifikasi DNA plasmid dengan elektrolisis DNA

Minggu 11